Reningsanläggningen ligger under mark vid Tegelbacken. Förutom inläckande grundvatten renar anläggningen regnvatten och snöslask som följer med tågen in i tunnlarna.
I reningsanläggningen finns sedimentationsbassänger där partiklar i vattnet sjunker till botten och vattnet renas.
Sedan pumpas vattnet till en kommunal dagvattenledning som leder ut vattnet i Mälaren vid Riddarfjärden. En del av vattnet leds också tillbaka till grundvattenmagasinen.