Banan är 113 km lång, enkelspårig, elektrifierad, fjärrblockerad och styrs från Göteborg. Nuvarande hastighet är 90–160 km/tim.
Jönköpingsbanan trafikeras av både persontrafik och godstrafik. 48 persontåg och 13 godståg trafikerar sträckan Nässjö–Jönköping per dygn. Mellan Jönköping och Falköping är siffrorna 33 persontåg och 12 godståg per dygn.
Jönköpingsbanan trafikeras av regionaltåg mellan Nässjö och Skövde/Göteborg samt mellan Jönköping och Östergötland, samt även med en dubbeltur med snabbtåg mellan Stockholm och Jönköping.